{"id":9558,"date":"2015-06-10T17:10:17","date_gmt":"2015-06-10T15:10:17","guid":{"rendered":"https:\/\/wpethzprd.ethz.ch\/id\/?p=9558"},"modified":"2015-06-10T17:10:43","modified_gmt":"2015-06-10T15:10:43","slug":"zweite-icy-coding-party","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/2015\/06\/10\/zweite-icy-coding-party\/","title":{"rendered":"Zweite Icy Coding-Party"},"content":{"rendered":"<p><a href=\"http:\/\/icy.bioimageanalysis.org\" target=\"_blank\">Icy<\/a> ist eine der benutzerfreundlichsten Plattformen f\u00fcr Bio-Bildanalysen.<!--more--><\/p>\n<p>Vom 4. bis 6. Mai fand am Institut Pasteur in Paris eine \u00abCodierungs-Party\u00bb statt (auch <a href=\"http:\/\/de.wikipedia.org\/wiki\/Hackathon\" target=\"_blank\">Hackaton<\/a> genannt). Bei dieser Gelegenheit unterst\u00fctzte das Icy-Team rund 20 Teilnehmende bei der L\u00f6sung ihrer spezifischen Probleme mit der Icy-Plattform. Gleichzeitig konnte Werbung f\u00fcr Icy gemacht werden. Zwei Mitglieder der ETH Z\u00fcrich aus der ID-Abteilung Scientific IT Services (<a href=\"https:\/\/www1.ethz.ch\/id\/about\/sections\/sis\" target=\"_blank\">ID SIS<\/a>), Piotr Kupczyk und Juan Fuentes, wurden zu der Veranstaltung eingeladen. Sie sollten einen Icy-Plug-in f\u00fcr die Integration von Icy mit dem an der ETH entwickelten openBIS Datenbanksystem entwickeln.<\/p>\n<p>Dieses Plug-in erm\u00f6glicht Forschenden, durch die Nutzung der \u00f6ffentlichen Remote-API von openBIS, mit zwei verschiedene Methoden auf die openBIS Datenbank zuzugreifen.<br \/>\nAls erstes geht es um Bilder-Analyse, welche in openBIS mit Icy gespeichert sind. Forschende k\u00f6nnen Dateien, welche in einer Remote-openBIS Datenbank gespeichert sind, direkt \u00f6ffnen ohne die Icy Analyseumgebung zu verlassen.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS1_Icy.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-9560\" src=\"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS1_Icy-300x165.png\" alt=\"openBIS1_Icy\" width=\"300\" height=\"165\" srcset=\"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS1_Icy-300x165.png 300w, https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS1_Icy-1024x566.png 1024w, https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS1_Icy.png 1280w\" sizes=\"auto, (max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/a><\/p>\n<p>Als zweites k\u00f6nnen Forschende eine Workflow-Erstellung Schnittstelle verwenden, um ihre Arbeitsabl\u00e4ufe zu definieren. Diese kann dann sp\u00e4ter im Batch-Modus ausgef\u00fchrt werden, beispielsweise auf einem Cluster.<\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS2_Icy.png\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\"alignnone size-medium wp-image-9561\" src=\"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS2_Icy-300x165.png\" alt=\"openBIS2_Icy\" width=\"300\" height=\"165\" srcset=\"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS2_Icy-300x165.png 300w, https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS2_Icy-1024x564.png 1024w, https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/files\/2015\/05\/openBIS2_Icy.png 1280w\" sizes=\"auto, (max-width: 300px) 100vw, 300px\" \/><\/a><\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p>Die Entwicklung des Plug-ins ist nun abgeschlossen. In K\u00fcrze wird es im Icy Plug-in-Repository ver\u00f6ffentlicht.<br \/>\nDie Bilder in diesem Artikel sind Teil der Pr\u00e4sentation, welche w\u00e4hrend der letzten Tage der Icy Codierungs-Party stattfand. Die Pr\u00e4sentation wurde von dem Icy-Team aufgenommen und kann bei<a href=\"https:\/\/www.youtube.com\/watch?v=-Xgi3K9qBHA#t=231\" target=\"_blank\">YouTube<\/a> (3.40 bis 5.30) angeschaut werden.<\/p>\n<p>Juan und Piotr mochten sich bei dem Icy-Team, Stephane Dallongeville, Alexandre Dufour und Fabrice de Chaumont herzlich bedanken. Ihre Unterst\u00fctzung vor, w\u00e4hrend und nach der Veranstaltung hat sehr viel beigetragen, diese Entwicklung m\u00f6glich zu machen.<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Icy ist eine der benutzerfreundlichsten Plattformen f\u00fcr Bio-Bildanalysen.<\/p>\n","protected":false},"author":838,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[25,1181,890,898,1178],"tags":[173280,173279,173278],"class_list":["post-9558","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-news","category-passwort-applikationen","category-speicher","category-support","category-wissenschaftl-rechnen","tag-hackaton","tag-icy","tag-icy-coding-party"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9558","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/users\/838"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=9558"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/9558\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=9558"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=9558"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=9558"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}