{"id":7582,"date":"2013-09-24T13:09:31","date_gmt":"2013-09-24T11:09:31","guid":{"rendered":"https:\/\/wpethzprd.ethz.ch\/id\/?p=7582"},"modified":"2013-09-24T13:09:31","modified_gmt":"2013-09-24T11:09:31","slug":"scientific-it-services-unterstutzt-eth-forschung","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/blogs.ethz.ch\/id\/2013\/09\/24\/scientific-it-services-unterstutzt-eth-forschung\/","title":{"rendered":"Scientific IT Services unterst\u00fctzt ETH Forschung"},"content":{"rendered":"
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Start und Aufbau einer neuen Abteilung f\u00fcr die ETH Forschung.<\/p>\n

Die wissenschaftliche IT ist in vielen Forschungsbereichen ein seit langem verwendetes Werkzeug. Neben eigentlichen Forschungsaufgaben, wie dem Entwickeln neuer Algorithmen und Computermodellen, z\u00e4hlt zu diesem Bereich auch ein steigender Anteil an IT-Dienstleistungen. Dazu geh\u00f6ren ebenfalls das Betreiben von Servern f\u00fcr das wissenschaftliche Rechnen sowie das Schreiben und Warten von Software f\u00fcr die Forschung. Diese wissenschaftlichen IT-Dienstleistungen werden bisher zum gr\u00f6ssten Teil in den Instituten und Gruppen erbracht. Nun haben die Informatikdienste zur B\u00fcndelung dieser Dienstleistungen die neue Abteilung Scientific IT Services (kurz: SIS) gegr\u00fcndet.<\/p>\n

High Performance Computing<\/h2>\n<\/div>\n

Der erste Bereich, in welchem entsprechende Aufgaben zentral erbracht wurden, ist das High Performance Computing.\u00a0Schon im Jahr 2004 nahmen die Informatikdienste den ersten zentralen Beowulf-Cluster\u00a0\u00abHreidar\u00bb in Betrieb. Dieser Dienst wurde ausgebaut, als im Jahr 2007 die HPC-Gruppe bei den Informatikdiensten geschaffen und im Jahr darauf die erste Generation des Rechenclusters \u00abBrutus\u00bb in Betrieb genommen wurde. Diesen Cluster betreibt die HPC-Gruppe heute schon in der dritten Generation. Er wird von Forschenden aus fast allen Departementen der ETH Z\u00fcrich genutzt. Um der weiter steigenden Nachfrage gerecht zu werden, plant die ID nun den Aufbau eines neuen Rechenclusters namens \u00abEuler\u00bb, welcher Brutus in naher Zukunft erg\u00e4nzen wird.<\/p>\n

Wissenschaftliche Software, Daten und Workflows<\/h2>\n

Der Bereich HPC war der erste, aber blieb nicht der einzige, in dem Forschende den Wunsch nach professioneller Unterst\u00fctzung mit wissenschaftlichen IT-Dienstleistungen \u00e4usserten. Im Bereich der Lebenswissenschaften stiegen durch neue und genauere Messmethoden, die verst\u00e4rkte Verwendung theoretischer, computergest\u00fctzter Methoden und durch den systembiologischen Ansatz die Datenmengen und die Datenkomplexit\u00e4t exponentiell an. Entsprechend nahm der Aufwand stark zu, diese Daten zu verwalten, zu analysieren, zu visualisieren und zu publizieren. In dieser Situation wurde 2006 das Center for Information Sciences and Databases (kurz: CISD) gegr\u00fcndet, um die Forschenden in diesem Bereich durch das Schreiben wissenschaftlicher Software und insbesondere beim Daten- und Workflow-Management zu unterst\u00fctzen. Im Jahr 2009 wurde vor demselben Hintergrund das SyBIT-Projekt (Systems Biology IT) von SystemsX.ch gegr\u00fcndet, um die Unterst\u00fctzung der SystemsX-Forschungsprojekte mit wissenschaftlicher IT schweizweit zu organisieren. SyBIT-Mitarbeitende haben seither auch an der ETH Z\u00fcrich wesentliche Beitr\u00e4ge beim Aufbau komplexer Datenauswertungs-Pipelines geleistet:\u00a0Zum Beispiel im Bereich der Massenspektrometrie und des \u00abHigh Content Screenings\u00bb.<\/p>\n

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\"_MG_9082\"<\/a><\/p>\n

Dr. Olivier Byrde (links) h\u00e4lt einen Rechenknoten; Dr. Bernd Rinn und Manuel Kohler zeigen ein Foto vom Inneren einer Sequenziermaschine.<\/em><\/p>\n

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Die neue ID-Abteilung Scientific IT Services soll diese Dienstleistungen nun b\u00fcndeln und einem gr\u00f6sseren Kreis von Forschenden \u2212\u00a0auch aus anderen Bereichen als den Lebenswissenschaften \u2212\u00a0zug\u00e4nglich machen. Die Struktur von SIS ist in der Abbildung dargestellt. Die Angebote werden mit den wissenschaftlichen Kunden zusammen weiterentwickelt. Dabei legt SIS Wert auf die Integration der Dienstleistungen und wird, wo m\u00f6glich und sinnvoll, schon bestehende Dienste nutzen und mit anderen Dienstanbietern zusammenarbeiten.<\/p>\n

\"Service-Angebot_SIS_neu\"<\/a><\/p>\n

Zugang zu den Angeboten von Scientific IT Services<\/em><\/p>\n

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Die Dienstleistungen von SIS stehen gegen eine Kostenbeteiligung allen ETH-Forschenden offen. Daf\u00fcr bietet SIS ein Beteiligungs-Modell an, das analog zu den Beteiligungen am HPC-Cluster Brutus funktioniert, sich allerdings auf Arbeitsleistung von SIS-Experten anstatt auf Rechenleistung bezieht. Die Departemente D-BSSE und D-BIOL haben sich schon in der Konzeptphase entschlossen, sich mit ihren Forschungsgruppen an SIS in dieser Form zu beteiligen. Weitere Departemente und Einheiten haben ihr Interesse an einer Beteiligung angemeldet. Als Erg\u00e4nzung zum Beteiligungsmodell arbeitet SIS auch auf Projektbasis.<\/p>\n

Nachdem in den letzten Monaten haupts\u00e4chlich Konzepte ausgearbeitet und unter den Beteiligten abgestimmt wurden, ist der Aufbau der Abteilung Scientific IT Services jetzt am Laufen. Wer sich n\u00e4her informieren m\u00f6chte oder Interesse an einer Beteiligung hat, kann sich daf\u00fcr gerne an Dr.\u00a0Bernd Rinn wenden.<\/p>\n

Kontakt<\/h2>\n

Dr. Bernd Rinn, Abteilungsleiter ID Scientific IT Services<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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